口蹄疫和手足口病当然不是一回事，它们是截然不同的两种传染病，它们的主要区别在于：

　　1.病原体不同：口蹄疫的病原体是口蹄疫病毒，它属于人畜共患的病原体；而手足口病是由数种肠道病毒感染所致，各地流行中常见的病原体是柯萨奇病毒A16型。

　　2.传染源不同：口蹄疫病毒只会引起偶蹄类动物如牛、羊、猪、鹿、骆驼等发生，成为人患口蹄疫的传染源，只有先出现兽的疫情，才有可能使人患病；而手足口病的传染源是患者和携带肠道病毒的人，属于人类传染病。

　　3.传播途径不同：口蹄疫是通过接触病畜口腔、蹄冠部的溃烂瘢，经皮肤黏膜感染的，偶尔也有食用了病毒污染而又未加热(巴氏消毒)的奶感染的。因此，人患口蹄疫是极为散在地发生的；而手足口病是由于接触了病人，通过日常生活用品、食具、玩具的污染经口感染的，也可通过呼吸道传播。因此，可出现不同规模的流行。

　　4.发病人群不同：不同人患口蹄疫决定了与病畜的接触，发病人群的年龄广泛；而手足口病主要是幼儿传染病，3岁以下患儿占绝大多数，很少有超过5岁以上的。

　　5.症状体征不同：口蹄疫起病后主要表现为发热等全身中毒症状和局部疱疹损害两大特征；手足口病大多无热或低热，仅有呼吸道感染和口腔黏膜疱疹及手指、足部、臀部、膝部丘疹。