米洛舍维奇是被警方以“腐败和滥用职权”的罪名逮捕的，检察官指控涉嫌侵吞了价值3.9亿美元的国家财产。在中央监狱，他将被拘留30天，在此期间，他将接受贝尔格莱德地方法院的调查。

　　但对于上述指控，米洛舍维奇却认为这完全是在污蔑。他在狱中提交的一份起诉书中称，南联盟新政府逮捕他完全是“政治策划”的阴谋，他们是想以此玷污他领导南斯拉夫多年所取得的成绩，“因为我为了国家和人们的利益反对世界霸权”。

　　至于那3.9亿美元，米洛舍维奇表示，那是90年代初，用来援助波黑和克罗地亚境内的塞尔维亚武装分子的，目的是希望阻止波黑和克罗地亚两个共和国从南联盟分裂出去。米洛舍维奇坚称，自己从来没有侵吞过公款，只是由于这笔经费是提供给塞族军队用于“购买武器、弹药和其他需求”，属于国家机密，所以无法在国家财政预算中标明。

　　贝尔格莱德地方法院已表示，将追究米洛舍维奇拒捕并造成多人受伤的责任。南联盟警方2日也指控他“纵容”自己的保镖在特种警察3月31日试图逮捕他的行动中开枪拒捕，造成4名特种警察受伤，其中1人伤势严重。现在，米洛舍维奇的3名保镖已被逮捕，而一旦罪名成立，仅此一项，米洛舍维奇将面临最多可达15年的徒刑。

　　而随着米洛舍维奇的身陷囹圄，他以前的手下也纷纷落网。贝尔格莱德地区法院大法官维达·彼得罗维奇·什凯罗不久前表示，米洛舍维奇的3名前高参，其中包括两名南联盟政府前副总理尼古拉·沙伊诺维奇和约万·泽比奇以及南联盟政府前海关关长米哈利·凯尔泰什，不久将接受法庭的询问，就检方提出的他们与米洛舍维奇一起滥用职权贪污3.9亿美元巨额国家财产的指控作证。据南联盟方面透露，米洛舍维奇的牢房位于中央监狱一层，从外表看，与其他牢房别无二致。

　　这是一间低矮的房子，长4米，宽3米，墙壁为白色，地面是冰冷而坚硬的灰色水泥地，室内唯一的窗户是一扇百叶窗。房间里放着一张坚固的铁床和一张被漆成橄榄绿色的铁桌，还有一个陶瓷的洗脸池，便池是蹲式的。

　　由于在逮捕过程中，米洛舍维奇一再威胁称要自杀。因此，防止他自寻短见，是监狱看守的第一条要求。为此，监狱方面也采取了许多预防措施。比如，在米洛舍维奇牢房里，电灯是被铁丝网牢牢包围住的，而且整个房间里没有任何插座。另外，米洛舍维奇也被禁止穿他以前常穿的西服，因为穿西服就得系皮带或裤子吊带，而这是可以用来上吊自杀的。这样一来，他就只能改穿运动衫裤，虽然他现在很少能运动也不大想运动。

　　吃饭也有严格规定。一日三餐都没有钢刀钢叉，全是塑料的盘子和餐具，这些都是监狱工厂的产品。与其他囚犯不同的是，米洛舍维奇饭菜都在牢房内食用，看守通过牢房门上的一个洞进行传递。每次用饭完毕，米洛舍维奇都得自己洗刷餐具，然后再用看守递进的扫把和拖布打扫牢房，用完后再把扫把和拖布递到外面。在送饭的洞上面，还有一个小的窗口，看守可以透过这监视米洛舍维奇的一举一动。

　　在这里，剃须刀更是禁品。每次要刮胡子前，米洛舍维奇必须向看守借，看守然后递给他电动剃须刀，在他们注视下米洛舍维奇刮完胡须，剃须刀再被收回。

　　在接受记者采访时，中央监狱代理监狱长布拉努沙表示，米洛舍维奇刚到监狱时，心情十分烦躁，现在他的情绪已逐步稳定，已基本适应监狱生活，只是他有时仍对看守紧跟在场表示不满。而塞尔维亚司法部长弗拉丹·巴蒂奇也表示，他们对米洛舍维奇采取了人道主义的态度，并没有任何虐待。他说：“他(米洛舍维奇)有自己的房间，食物有保障，可以接受探访，可以穿自己的衣服和鞋子，还可以拥有钱、书籍和报纸。他不会受到任何形式的肢体折磨，也不会有精神压力。”

　　虽然条件清苦，但据监狱方面讲，对米洛舍维奇，他们已经是格外开恩了。

　　譬如，其他牢房都没有热水，但这里24小时有热水供应；其他牢房的电灯开关都在牢房门外，由看守掌握，但这间牢房电灯的开关则在房内，米洛舍维奇可随时掌握。据透露，对于这一点，米洛舍维奇还比较满意，他也因此晚上睡得很晚，以至于第二天老是晚起而常错过早饭。

　　另外，米洛舍维奇可以穿自己带的运动衫裤，而不必穿囚服。他每天可以在监狱的院子里散半个小时的步，不过，看守得寸步不离跟在他后面。

　　此外，米洛舍维奇每天都可以在一间特意安排的房间里呆两个小时，会见前来探视的亲人、朋友和律师。到目前为止，他的妻子米拉·马尔科维奇和女儿都曾经来看过他。米拉是3日下午来探视的，她和米洛舍维奇交谈了一个小时。据当时在场的塞尔维亚社会党官员伊吉奇介绍，谈的都是一些生活琐事，没有什么特别内容，米拉为米洛舍维奇带去了一些书籍。

　　据监狱负责人介绍，米洛舍维奇在牢中的饭菜虽然没法跟他在家中相比，但还算可以。一般情况下，他的早餐是茶和涂有奶油的面包片；午餐则是匈牙利式烩牛肉；晚餐则是火腿片。此外，他还可以吃家人探视时送来的罐头。

　　但现在人们最关心的，不是南联盟对米洛舍维奇的审判，而是他会不会被引渡给海牙国际战争罪行法庭受审。

　　米洛舍维奇被捕后，美国国务卿鲍威尔当即表示，美国将继续向南联盟提供总额为5000万美元的援助，但如果南联盟想得到其希望的10亿美元国际援助，就必须与海牙国际法庭合作。也就是说，必须将米洛舍维奇移交海牙法庭。

　　对于西方的压力，南联盟总统科什图尼察一再表示，南联盟不会将米洛舍维奇移交给海牙国际法庭受审，至于南3月31日开始逮捕米洛舍维奇，完全是时间上的巧合。南联盟不会屈从于外界的压力，因为“国家的尊严比美元更为珍贵”。

　　科什图尼察的话是有所指的，因为米洛舍维奇现在还拥有大量的支持者，如果贸然将他送往海牙受审，将无疑会使社会陷入分裂动荡，他的政府也将会背上侮辱国家尊严的罪名。

　　但一些分析家也认为，随着西方对南联盟压力的不断增大，科什图尼察能否顶住压力还很难说，米洛舍维奇最终命运如何也很难说。

　　也许是认识到米洛舍维奇的处境，为防止南政府将他引渡到海牙受审，米洛舍维奇的支持者也在不断向政府施加压力。4月7日，在贝尔格莱德市中心塞尔维亚政府大楼前，就有约两万名米洛舍维奇的支持者举行集会，他们高举南联盟和塞尔维亚共和国的国旗、塞尔维亚社会党的党旗以及米洛舍维奇的画像，要求政府立刻释放米洛舍维奇。

　　该党还宣布，以后还将举行群众集会，要求政府释放米洛舍维奇。

　　而对于米洛舍维奇最终的命运，他的兄长、南联盟前驻莫斯科大使博里斯拉夫·米洛舍维奇也感到忧虑。他说，虽然他相信科什图尼察决不引渡的讲话是真诚的，但贝尔格莱德那股主张出卖米洛舍维奇的势力最终可能占上风，他迟早将被他们送到海牙法庭去。而一旦米洛舍维奇被引渡，以他的性格，他肯定会选择自杀。