石井部队主要以研制生物武器为宗旨，大量繁殖鼠疫、伤寒、霍乱、炭疽、赤痢等传染病菌，并惨无人道地对健康人进行细菌试验，其细菌试验种类多达几十种。在盘踞中国东北十几年时间里，日本军国主义者以成千上万名中外无辜人士的生命为代价进行各类细菌试验，并把研制生产的生物武器在诺门罕、宁波、常德、浙赣铁路沿线等地区进行试验性的使用，残杀无辜百姓。在中国及东南亚战场实施大规模生物战，致使几十万中外民众死于生物战中。